石乐明 教授
复旦大学药学院 
个人网页：
http://spfdu.fudan.edu.cn/OutNet_T/TInf.aspx?ID=84
研究方向:
主要研究方向为药物基因组学、生物信息学和化学信息学。主要从基因组水平研究疾病、药物和药物不良反应的关系，为临床个体化用药提供指导和解决方案。具体研究主要包括：1）运用基因芯片、新一代测序、质谱以及核磁共振等作为标志性检测手段的组学技术，对临床样本从全基因组、转录组、蛋白质组及代谢组等组学层面研究个体对药物响应存在差异的原因，分析和挖掘与疾病相关的基因、转录本、蛋白或通路；2）推断易感基因在复杂疾病中的行为，并通过实验验证基因如何影响药物有效性或者安全性的机制；3）建立严重药物不良反应病人的组织样本库，以实现资源共享；4）针对组学数据的质量控制、数据处理、统计分析、结果解析等环节，提出基于数据特征的质量评价标准，优化标准数据分析方案。
近期发表论文:
1.Su Z, Li Z, …, Tong W, Shi L. Comparing  next-generation sequencing and microarray technologies in a toxicological study  of the effects of aristolochic acid on rat kidneys. Chemical Research in  Toxicology, 24(9), 1486-1493 (2011).

2.Wen Z, Wang Z, Wang S, Ravula R, Yang L, Xu  J, Wang C, Zuo Z, Chow MSS, Shi L, Huang Y. Discovery of molecular mechanisms  of traditional Chinese medicinal formula Si-Wu-Tang using gene expression  microarray and connectivity map. PLoS ONE, 6(3):e18278 (2011).

3.Shi L, Campbell G,…, Tong W, Wolfinger RD.  The MicroArray Quality Control (MAQC)-II study of common practices for the  development and validation of microarray-based predictive models. Nature  Biotechnology, 28(8), 827-838 (2010).

4.Shi L, Jones WD,..., Wolfinger RD, Tong W.  The balance of reproducibility, sensitivity, and specificity of lists of  differentially expressed genes in microarray studies. BMC Bioinformatics,  9(Suppl 9), S10 (2008).

5.Shi  L, Reid LH, …, Zong Y, Slikker W, Jr. The MicroArray Quality Control (MAQC)  project shows inter- and intraplatform reproducibility of gene expression  measurements. Nature Biotechnology, 24(9), 1151-1161 (2006).

6.Guo L, Lobenhofer EK, …, Dragan YP, Shi L.  Rat toxicogenomic study reveals analytical consistency across microarray  platforms. Nature Biotechnology, 24(9), 1162-1169 (2006).

7.Tong W, Lucas AB, …, Guo L, Shi L.  Evaluation of external RNA controls for the assessment of microarray  performance. Nature Biotechnology, 24(9), 1132-1139 (2006).