课程日程

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2016.08.02(周二)

13:00-18:00

课程学员报到

2016.08.03(周三)

8:30-8:35

课程开幕式

8:35-8:45

校领导致辞

8:45-9:00

课程学员合影

9:00-12:00

任兵

加州大学圣地亚哥分校

3D4D基因组及应用

染色质的高级结构与基因调控

Hi-CChIA-PET在染色质高级结构中的应用染色质高级结构的时空变化与调控

13:30-16:30

表观基因组学与精准治疗

肿瘤基因组与表观基因组相互关系

肿瘤相关的表观遗传学突变与肿瘤治疗与预后判断

单细胞的表观基因组学检测及分析

2016.08.04(周四)

9:00-12:00

伊成器

北京大学

表观基因组动态调控与机制

DNA去甲基化与Tet

DNA去甲基化产物5hmc等的生物学意义及检测

Tet的生物学意义及功能调控

13:30-16:30

邓大君

北京大学

表观基因组学与肿瘤发生发展和转移

肿瘤发生发展过程的DNA高甲基化与低甲基化的关系肿瘤转移的表观遗传学机制

2016.08.05(周五)

9:00-12:00

颉伟

清华大学

表观遗传学的遗传(Epigenetics inheritance

DNA甲基化的遗传问题与争论

组蛋白修饰遗传问题

非编码RNA的遗传问题

精子中的RNA与基因组印记

13:30-16:30

Danny Chi Yeu Leung

香港科技大学

表观基因组学与胚胎发育

胚胎发育早期DNA甲基化的动态变化

生殖干细胞DNA甲基化动态变化

iPS及转分化过程的DNA甲基化动态变化及意义

2016.08.06(周六)

9:00-12:00

马端

复旦大学

环境表观遗传学

环境毒素与表观遗传学改变

环境PM2.5M 与表观遗传学异常

13:30-16:30

李伟

复旦大学

表观遗传学常用软件及网络资源介绍

表观遗传学(DNA甲基化、非编码RNA及组白蛋白)常用软件及网络资源介绍。

肿瘤表观基因学常用数据库及网络资源介绍。

二代测序数据获取及分析实战。

2016.08.07(周日)

9:00-12:00

于文强

复旦大学

细胞核内miRNA功能与疾病

miRNA的核内定位分析

miRNA与增强子

细胞核内miRNA与胞浆miRNA协同与调控

细胞核内miRNA作用机制和疾病发生

13:30-16:30

汪海林

中科院生态环境研究中心

DNA损伤修复的表观遗传学

DNA损伤修复的基本概念,原理

同源重组修复与功能蛋白质组装调控

小分子调控DNA甲基化与去甲基化

DNA m6A修饰的功能和动态调控

 

2016.08.08(周一)

9:00-12:00

杨运桂

中科院北京基因组所

RNA修饰的表观遗传学

RNA的各种不同修饰与分类

m6A化学修饰的分布及生物学意义

m6A化学修饰的检测及功能研究

m6A化学修饰的动态调控

13:30-16:30

杨力

中科院上海计算生物学研究所

环状RNA与调控

环状RNA的产生与分类

环状RNAmiRNA调控

环状RNA与内含子和外显子的关系

环状RNA功能及生物学意义

2016.08.09(周二)

9:00-12:00

倪挺

复旦大学

表观遗传调控与基因剪切

基因剪切的生物学意义与检测

共转录水平的基因剪切与染色质修饰

基因剪切的生物信息学分析面临的挑战与策略

染色质修饰调控基因剪切的机制与疾病

染色质修饰与基因转录起始及转录终止的关系

RNA剪切与染色质修饰的相互影响

13:30-16:30

陈云弟

药明康德测序中心

高通量测序样品制备技巧

基因组测序样本制备

RNA测序样本制备

ChIP样本制备

DNA甲基化样本制备

2016.08.10(周三)

9:00-12:00

岳峰

宾夕法尼亚州立大学

增强子与基因表达调控

增强子与染色质修饰

增强子与细胞身份决定

增强子序列变异及突变与疾病

增强子与基因调控机制

13:30-16:30

张勇

同济大学

ChIP-seqDNA甲基化分析策略

ChIP-seq常用分析策略及问题解析

ChIP-seq分析优化及标准化

全基因组DNA甲基化分析策略及问题解析

2016.08.11(周四)

9:00-12:00

Thomas Gingeras

美国冷泉港实验室

非编码RNA与功能

非编码RNA的种类与调控方式

非编码RNA与编码RNA转换

非编码RNA与染色质修饰

非编码RNA与表观调控复合体

非编码RNA与疾病

13:30-16:30

岳峰

宾夕法尼亚州立大学

ENCODERoadMap Epigenomics

ENCODE项目介绍

ENCODE应用软件和资源分享

Roadmap表观基因组学资源展示及应用

2016.08.12(周五)

9:00-12:00

Thomas Gingeras

美国冷泉港实验室

Circulating RNAexsome

exome 的概念和功能

exome RNA与细胞间通信

exome miRNA与肿瘤转移

exome 的检测和研究策略

13:30-14:30

Fred Tyson

NIH

表观基因组学研究的现状与展望

NIH Roadmap表观基因组学计划的背景和意义

表观基因组学计划完成情况和主要研究成果

表观基因组学计划的教训与未来挑战

14:30-16:30

Hillary Sussman

Fred Tyson

Thomas Gingeras

岳峰,于文强

师生互动交流

学员学习成果汇报

选取学员中优秀的Proposal进行集中展示

由带教老师点评

16:30-16:40 课程闭幕式